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01.成果簡介   “相”是指物質系統中物理、化學性質完全相同，與其他部分具有明顯分界面的均勻部分。“相變”是指物質從一種相轉變為另一種相的過程。與固、液、氣三態對應，物質有固相、液相、氣相。有研究表明，相變機制也廣泛存在于生物細胞中，且在細胞生命周期的時空調控等方面發揮著重要的生物學功能。當溶液中的多價大分子與其多價配體互作時，容易產生更大的復合物，后者的溶解度一般會降低，從而從普通溶液相分離出來，形成一個復合物富集的獨立的液態相，這個轉變過程被稱為“液-液分離相變”（即，“相變”）。 蛋白質翻譯后修飾是指蛋白質翻譯完成后，發生在蛋白質的特定氨基酸殘基上的共價修飾過程，是蛋白質生物合成的步驟之一。目前，已知存在300多種翻譯后修飾，常見的有甲基化、乙酰化、磷酸化、泛素化、糖基化修飾等，與蛋白質翻譯后修飾相反的修飾過程為蛋白質去修飾，如去甲基化、去乙酰化、去磷酸化、去泛素化、去糖基化等。 本項成果是一種檢測翻譯后/復制后/轉錄后修飾的蛋白質/DNA/RNA與其修飾閱讀器間相互作用的成套試劑，由A、B、C和D四種試劑組成；（1）A由名稱為R的生物分子和名稱為X的蛋白質連接而成；（2）B含有名稱為L的生物分子；R與L相同或不同且二者間具有相互作用，R與L相互作用后發生相變；（3）C為由C單體形成的多聚體，C單體由名稱為mc的單體、名稱為甲的報告基團和名稱為YC的生物分子連接得到的分子，大于等于兩個的mc能形成多聚體；（4）D由名稱為XL的帶有修飾的蛋白質和名稱為YD的生物分子連接而成；YC與YD間具有相互作用。通過該成套試劑及基于該成套試劑創建的多價招募系統，利用相變機制實現了互作蛋白和配體在相變液滴中的高度富集，將原本較弱的互作信號強烈放大，使其易于檢測。02.應用前景 本項成果可以為檢測經翻譯后/復制后/轉錄后修飾的蛋白質/DNA/RNA與其修飾閱讀器間的相互作用提供一種全新的技術手段。該技術尤其適合高通量篩選修飾酶或去修飾酶的抑制劑或促進劑。03.知識產權 本項成果已申請1項發明專利。04. 團隊介紹 本項成果負責人為清華大學研究員、博士生導師、清華大學結構生物學高精尖創新中心成員、清華-北大生命科學聯合中心成員、中組部“青千”基金獲得者，主要從事“相變”相關領域的研究，并探索能夠廣泛應用于鑒定生物大分子互作及互作調控物篩選的新技術。研究成果發表于多個國際頂級權威期刊，申請專利多項。05.合作方式 專利許可、合作開發。06.聯系方式 [email protected]

【發 明 人】樊文玲；肖偉；郭峰；潘林梅；朱運 【摘要】 堿性中藥活性蛋白類成分吸附后膜的吸附和解吸裝置及吸附和解吸方法。該裝置由膜組件、循環泵、提取液或解吸液雙層儲料槽、滲透液儲料槽、壓力表、流量計、恒溫水浴、蠕動泵、不銹鋼管道制成。該方法為：在0.25MPa下恒溫，膜超濾吸附含量為98%的堿性中藥活性蛋白類提取物溶液24h，計算活性成分吸附量，將吸附后的膜裝在解吸裝置上，將pH為5的鹽酸溶液作為解吸劑，恒溫，在壓力小于0.05MPa和膜面流速在0.1-1m/s條件下進行解吸，得解吸率95%-99%。該方法和裝置適用于堿性中藥蛋白類成分的膜精制過程，尤其是注射劑除熱原和樹脂過程，可大大降低該類活性成分的損失率，提高其轉移率，同時膜獲得較好的再生。

血管活性腸肽(vasoactiveintestinalpeptide，VIP)是一種由 28 個氨基酸組成的多肽，主要是由外周神經和中樞神經系統產生，由副交感神經節后纖維釋放，并且與乙酰膽堿共同存在，被認為是胰高血糖素-胰泌素家族的一員。廣泛分布在中央神經系統的類膽堿突觸前神經細胞和外周肽能神經細胞中，通過它可對多種器官進行神經支配，比如心臟，肺，消化系統和泌尿生殖道，眼睛，皮膚，卵巢和甲狀腺。VIP 在中樞和外周神經系統中是一種重要的信號肽，通過其受體發揮生理作用，迄今為止，已有 3 種類型的 V

積極地從血液中去除β2-MG可以有效地預防和治療DRA。 一、項目分類 關鍵核心技術突破 二、成果簡介 β2微球蛋白(β2-Microglobulin，β2-MG)是由淋巴細胞、血小板、多形核白細胞產生的一種小分子球蛋白，是主要組織相容性復合物(MHC-Ⅰ )的輕鏈部分，由99個氨基酸組成，分子量為11.8KD，半徑1 .6nm，可以從腎小球自由濾過，99.9％在近端腎小管吸收，并在腎小管上皮細胞中分解破壞。正常人血清中β2-MG的含量是0 .5～3mg/L。長期接受透析治療的腎損傷患者體內β2-MG容易產生積聚，從而引發透析相關性淀粉樣病變(DialysisRelated Amyloidosis，DRA)。病理條件下，腎損傷患者血液中的β2-MG的含量是正常水平的50-60倍，約為84mg ,主要癥狀表現為關節和關節周圍組織淀粉樣蛋白的沉積，從而導致骨骼和關節的病原性病變。透析多年的腎病患者，DRA臨床癥狀包括腕管綜合征(CTS)、骨關節病、破壞性關節病、囊性骨病和病理骨折。血液透析治療15年以上的患者，將出現系統性淀粉樣病變。因此，積極地從血液中去除β2-MG被認為是有效地預防和治療DRA。

本發明提供了用于檢測不同基因型雞新城疫病毒(NDV)的試劑盒，屬于RT?PCR檢測技術領域。本發明的試劑盒含有一對特異性引物，其核苷酸序列分別如SEQ ID NO.1?2所示。本發明還提供了檢測不同基因型雞新城疫病毒的方法。本發明試劑盒和檢測方法具有高特異性、高靈敏度、高效率、通用性好、低成本的特點，可在6h內對臨床病料進行快速鑒別診斷，本發明為NDV的早期快速診斷和開展分子流行病學調查提供技術手段，以更好地指導養禽生產中對該病的防控。

本發明公開了一種黃牛TAS1R2基因的單核苷酸多態性及其檢測方法，其基因單核苷酸多態性包括：以包含TAS1R2基因的待測黃牛全基因組DNA為模板，以引物對P為引物，PCR擴增黃牛TAS1R2基因；對產物進行變性后，再對變性后的擴增片段進行聚丙烯酰胺凝膠電泳；根據電泳結果鑒定黃牛TAS1R2基因第288bp的堿基多態性。該方法是一種在DNA水平上篩查和檢測與黃牛產肉性狀密切相關的分子遺傳標記，以用于黃牛的輔助選擇和分子育種，加快黃牛良種繁育速度

南京郵電大學理學院曾紅麗副教授與合作者在新型冠狀病毒SARS-CoV-2基因序列分析方面取得重要進展，預測了該病毒在自然選擇過程中的適應性，指出并分析了該病毒在演化過程中存在的弱點，分析了相應綜合醫藥開發應注意的關鍵基因位點。該成果以南京郵電大學為第一完成單位，于2020年11月17日在線發表于國際權威期刊美國國家科學院院刊（PNAS）上。 COVID-19疫情是由β-冠狀病毒SARS-CoV-2引起的全球性公共衛生突發事件。各類數據庫搜集了大量的且不斷增加的高質量全基因組序列。本工作利用這些序列，研究其是否顯示出病毒演化過程中上位性對適應性的影響。在具有高重組率的種群演化中，本工作創新性地發展和應用了統計物理學中的反Potts模型，來檢測自然選擇過程中的上位性影響。該工作為利用大量基因組序列來獲取具有高重組率的病原體在演化過程中的弱點開辟了廣闊前景。 該研究工作最終將新型冠狀病毒的大約3萬個基因位點濃縮為存在顯著相互影響的8對基因位點（ORF3a和nsp2，nsp12和nsp6，ORF8和nsp4，以及基因nsp2，nsp13和nsp14），為尋找病毒病原體結合和重組過程中存在的弱點帶來了希望，對開發臨床治療的綜合靶向藥物、研究病毒進入宿主后的發病機制有著很強的生物醫學指導意義。 和其他許多疾病一樣，針對COVID-19的潛在藥物靶標的組合數量非常多。本研究工作不僅提供了哪些基因位點之間存在相互影響，并可以對其進行排名，從而進行更進一步詳細研究。結合隨機性檢驗，該研究工作最終預測了存在顯著上位性的8對基因位點中，有3對涉及到與新冠肺炎的重癥密切相關的病毒基因ORF3a。遺憾的是，目前關于針對ORF3a基因的臨床靶向藥物的報道還較為罕見，值得醫藥學研究人員在該方面加強研究。另外，本研究工作中預測的8對基因位點可作為實驗生物學的原假設，以供生物學研究人員在此基礎上設置相關微生物實驗，研究新冠病毒進入人體后引起發病的機理。 此項研究工作由南京郵電大學與意大利的里雅斯特大學、古巴哈瓦那大學、瑞典哥德堡大學及瑞典皇家理工大學合作完成。曾紅麗副教授的研究工作受到國家自然科學基金委（基金號11705097）、江蘇省科學技術廳（基金號BK20170895）以及江蘇省政府留學獎學金的大力支持。

本發明涉及基因工程技術領域，特別涉及甘藍型油菜及其親本物種白菜和甘藍TT2基因家族及其應用； 所述白菜透明種皮2的基因家族包括2個成員：BrTT2-l基因和BrTT2-2基因，所述甘藍TT2的基因家族的 1個成員BoTT2基因，所述甘藍型油菜TT2基因家族包括3個成員：BnTT2-l基因、BnTT2-2基因和BnTT2- 3基因；蕓菱屬6個TT2基因之間具有很高的同源性；本發明還公開了上述基因家族在植物分子育種中的應 用,通過反義抑制其在黑籽甘藍型油菜中的表達后,轉基因植株發生了種皮顏色變淺等性狀變化，具有創造 轉基因黃籽材料的潛力。

本發明涉及基因工程技術領域，特別涉及甘藍型油菜及其親本物種白菜和甘藍MYBL2基因家族及其應 用；所述白菜MYBL2基因家族包括2個成員：BrMYBL2-l基因和BrMYBL2-2基因，所述甘藍MYBL2基因家 族包括2個成員：B0MYBL2-1基因和BoMYBL2-2基因，所述甘藍型油菜MYBL2基因家族包括4個成員： BnMYBL2-l基因、BnMYBL2-2基因、BnMYBL2-3基因和BnMYBL2-4基因；蕓臺屬8個MYBL2基因之間具 有較高的同源性；本發明還公開了上述基因家族在植物分子育種中的應用，通過構建正義超量表達植物載體，轉化黑籽甘藍型油菜品種中雙10號后，獲得6株轉基因植株。與非轉基因的外植體對照相比，轉基因植 株生長發育正常，但種皮中原花青素等色素減少，同時種皮變薄，形成轉基因黃籽性狀，是油菜黃籽性狀育 種的新資源。

 三疣梭子蟹基因組圖譜     唐伯平供圖蝦蟹類基因組是公認的高復雜基因組，要獲得高質量的基因組有著很多困難。近日，由鹽城師范學院江蘇省鹽土生物資源研究重點實驗室教授唐伯平課題組牽頭的中外合作團隊，第一次獲得了我國重要淡水和海水經濟蟹類中華絨螯蟹和三疣梭子蟹的高質量基因組圖譜，并分別在線發表于GigaScience和《遺傳學前沿》。三疣梭子蟹（Portunus trituberculatus）是我國沿海大型的海洋經濟蟹類，我國每年捕撈量在55萬噸左右。唐伯平團隊獲得的三疣梭子蟹基因組大小為1.00Gb，片段重疊群N50的長度為 4.12Mb，被注釋到16796個蛋白編碼基因，其基因組的完整性為94.7%，整個基因組的重復序列是54.52%。科研人員鑒定出三疣梭子蟹染色體為50對，裝配率為97.80%，Hi-C的N50為21.79Mb。這是一個高質量、相當完整的染色體水平基因組，也是蟹類研究中第一次通過分子生物學的方法精確地對蟹類染色體數目進行鑒定。 三疣梭子蟹    唐伯平供圖中華絨螯蟹（Eriocheir japonica sinensis）俗稱河蟹，是世界上最重要的淡水經濟蟹類，目前我國每年河蟹產量為80萬噸左右。研究人員獲得的中華絨螯蟹基因組大小為1.27Gb，Contig序列N50為3.19Mb，且其GC含量為43%，高于其他節肢動物。BUSCO評估其完整性為94.00%，重復序列在基因組中占61.42%，被功能注釋蛋白編碼基因22619個。 中華絨螯蟹   唐伯平供圖唐伯平團隊對甲殼動物中華絨螯蟹、三疣梭子蟹、凡納濱對蝦，昆蟲埃及伊蚊、黑腹果蠅、偏瞳蔽眼蝶、蜘蛛等7種節肢動物基因家系展開進一步研究發現，它們共有15503個基因家系，其中8832個基因家系為共有家系，328個和544個基因家系分別唯一存在于三疣梭子蟹和中華絨螯蟹中。在這7種節肢動物中，蝦蟹相對進化速率最小，其中對蝦進化速度最慢，其次是絨螯蟹和梭子蟹。“相對于昆蟲，蝦蟹類進化較慢，可能是它們生活的環境相對于昆蟲更加穩定。”唐伯平說。 蝦蟹系統演化關系和相對進化速率圖     唐伯平供圖另一個有趣的發現是，蝦蟹與昆蟲的分化以及螃蟹和對蝦的分化幾乎是同時發生在4.3億年左右的志留紀。同屬于短尾類的中華絨螯蟹和三疣梭子蟹的分化時間則相對較晚，大約是在1.8億年前的侏羅紀。我國同時獲得1種海洋和1種淡水重要經濟蟹類高質量的基因組圖譜，將為蟹類和甲殼動物的研究提供重要的理論基礎和數據支撐，同時也為經濟蟹類育種、養殖和疾病防控工作提供重要的基礎平臺。相關論文信息：https://doi.org/10.1093/gigascience/giz161https://doi.org/10.3389/fgene.2019.01340