大數(shù)據(jù)挖掘在植物表觀遺傳組學中的應用
近年隨著測序技術的不斷完善,生物領域積累了大量基因組、轉錄組、表觀組學數(shù)據(jù)。怎樣有效利用這些數(shù)據(jù)挖掘生物學新知識,是研究工作者在大數(shù)據(jù)時代面臨的挑戰(zhàn)。該研究以DNA甲基化測序數(shù)據(jù)入手,探索了大數(shù)據(jù)挖掘揭示生物學新知識的研究之路。翟繼先課題組重新分析了公共數(shù)據(jù)庫中來自不同實驗室的約500余組Col-0型擬南芥DNA甲基化數(shù)據(jù):通過比較單個突變體和多個野生型,鑒定了每個突變體中高置信度的DNA甲基化差異區(qū)域,進而分析了不同突變體間DNA甲基化差異區(qū)域的重合度,揭示控制DNA甲基化相關基因之間的聯(lián)系。
南方科技大學
2021-04-13