SARS-CoV-2與SARSr-CoV存在趨同進化的研究
2020年3月5日,東北師范大學(xué)在bioRxiv上上傳了一篇Strong evolutionary convergence of receptor-binding protein spike between COVID-19 and SARS-related coronaviruses的研究,該研究發(fā)現(xiàn)SARS-CoV-2和SARS-CoV存在遠(yuǎn)緣關(guān)系,但兩者都能夠通過同一受體ACE2感染人類宿主,并引起相似的臨床和病理特征,表明S蛋白可能存在趨同進化。然而,其趨同的分子基礎(chǔ)仍不得而知。本研究中使用最近開發(fā)的分子植物生態(tài)學(xué)方法來研究趨同的分子基礎(chǔ)。分析表明,S蛋白在SARS-CoV-2和SARS-CoV相關(guān)分支沿線經(jīng)歷了大量有意義的達(dá)爾文選擇。進一步研究顯示,SARS-CoV-2和SARSr-CoV類之間S蛋白的受體結(jié)合域(RBD)中趨同進化的氨基酸位點比例異常高,導(dǎo)致RBD序列在系統(tǒng)發(fā)生上的聯(lián)合。除了S蛋白,作者還發(fā)現(xiàn)其伙伴蛋白ORF3a的趨同進化。結(jié)果表明,SARS-CoV-2與SARSr-CoV之間具有很強的適應(yīng)性趨同進化,可能促進它們對類似或相同受體的適應(yīng)性。最后,作者指出,許多觀察到的蝙蝠SARS-like-CoVs與SARS-CoV-2和SARS-CoV的S蛋白的RBD序列存在趨同進化,可能預(yù)先適應(yīng)人類宿主受體ACE2,因此將是潛在的新的冠狀病毒來源。
東北師范大學(xué)
2021-04-11