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發(fā)明公開(kāi)了一種基于關(guān)聯(lián)分析與關(guān)聯(lián)分類(lèi)的蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)技術(shù)，以雙庫(kù)協(xié)同機(jī)制為基礎(chǔ)，將KDD*過(guò)程模型引入蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)問(wèn)題中，KAAPRO方法以數(shù)據(jù)挖掘(知識(shí)發(fā)現(xiàn))為主體，采用基于KDD*過(guò)程模型Maradbcm算法以及關(guān)聯(lián)規(guī)則分類(lèi)D-CBA方法。KAAPRO方法所取得關(guān)聯(lián)規(guī)則在一定程度上揭示了氨基酸物化屬性對(duì)蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的影響關(guān)系，從而提高了預(yù)測(cè)的精度。其中Maradbcm算法挖掘意外規(guī)則的特性對(duì)純度較高的α蛋白質(zhì)庫(kù)與β蛋白質(zhì)庫(kù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)規(guī)則的挖掘，由此獲得的挖掘結(jié)果是精化的規(guī)則。D-CBA關(guān)聯(lián)分類(lèi)方法使用可信度與支持度的測(cè)度作為一個(gè)復(fù)合型度量來(lái)進(jìn)行蛋白質(zhì)關(guān)聯(lián)分類(lèi)。在保證預(yù)測(cè)精度的同時(shí)，為生物學(xué)家對(duì)二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)一步分析提供了依據(jù)。

項(xiàng)目簡(jiǎn)介 腦卒中為腦血管破裂或血栓阻塞血管導(dǎo)致大腦缺血損傷，其治療的藥物非常缺乏，阿替普酶是迄今為止唯一獲得FDA批準(zhǔn)用于缺血性腦卒中的溶栓藥物,易引起再灌注損傷,可延長(zhǎng)其給藥時(shí)間窗和減輕再灌注損傷。但臨床上神經(jīng)保護(hù)劑十分缺乏。本項(xiàng)目為腦中風(fēng)治療的小分子蛋白藥物研究，包括兩個(gè)小分子量蛋白。其一是犬鉤蟲(chóng)抗凝多肽5（AcAP5），是一種具有強(qiáng)效抗血栓形成（抑制FXa）和溶血栓（抑制TAFIa）兩種功能的蛋白，其中溶栓作用為本團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)（已申請(qǐng)專(zhuān)利并獲得授權(quán)）。其二是在AcAP5基礎(chǔ)上改造的蛋白TBN（已申請(qǐng)專(zhuān)利），具有溶栓和神經(jīng)保護(hù)作用功能。體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)表明AcAP5和TBN均具有較好的溶栓（溶解動(dòng)脈血栓）、抗栓（預(yù)防腦中風(fēng)血栓溶解過(guò)程中血栓再形成）和神經(jīng)保護(hù)作用（減小梗死體積），“三位一體”的功能使其具有更好的治療腦卒中效果。項(xiàng)目團(tuán)隊(duì) 王銀葉，教授，在心血管領(lǐng)域特別是腦卒中新藥研究方面有20多年的經(jīng)驗(yàn)，發(fā)表了數(shù)十篇相關(guān)文章，主持過(guò)多項(xiàng)國(guó)家自然基金和科技部項(xiàng)目。項(xiàng)目骨干：朱元軍，博士，講師。擅長(zhǎng)蛋白質(zhì)/多肽的設(shè)計(jì)、表達(dá)和純化工藝研究。項(xiàng)目骨干：劉曉巖，博士，講師。擅長(zhǎng)腦卒中的疾病模型構(gòu)建，以及藥物的藥理活性評(píng)價(jià)及機(jī)制研究。以及碩士研究生4名。整個(gè)團(tuán)隊(duì)具有蛋白設(shè)計(jì)、表達(dá)、純化、分子機(jī)制和藥效學(xué)評(píng)價(jià)等技術(shù)能力和條件。 應(yīng)用范圍 AcAP5和TBN可用于急性缺血性腦卒中患者的治療。流行病學(xué)調(diào)查結(jié)果表明，我國(guó)每年腦卒中新發(fā)病例高達(dá)200余萬(wàn)，假設(shè)僅僅5%的病人（10萬(wàn)）接受10000元的AcAP5或TBN等蛋白治療，則年銷(xiāo)售額可望達(dá)到10億元。項(xiàng)目階段 本項(xiàng)目處于臨床前研究階段。體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)表明AcAP5和TBN均具有較好的抗栓、溶栓和腦保護(hù)作用，150 nmol/kg給藥劑量下AcAP5和TBN均可顯著減少小鼠腦梗死的體積。

一種樂(lè)昌含笑Mc-Hmgr蛋白編碼序列，屬于基因工程領(lǐng)域。所分離出的DNA分子包括：編碼具有樂(lè)昌含笑Mc-Hmgr蛋白活性的多肽的核苷酸序列，所述的核苷酸序列與SEQ ID NO.3中從核苷酸第56-1726位的核苷酸序列有至少70％的同源性；或者所述的核苷酸序列能在40-55℃條件下與SEQ ID NO.3中從核苷酸第56-1726 位的核苷酸序列雜交。本發(fā)明是一種3-羥基-3-甲基戊二酰輔酶A的還原酶，有助于提高樂(lè)昌含笑中次生代謝產(chǎn)物或其前體的含量，次生代謝產(chǎn)物具有雙向調(diào)節(jié)人體血壓的作用，并可降低人體膽固醇含量，預(yù)防心腦血管硬化等功能。對(duì)于保護(hù)人民的健康生長(zhǎng)有所幫助。

一種南京椴tm-Hmgr蛋白編碼序列，屬于基因工程領(lǐng)域。所分離出的DNA 分子包括：編碼具有南京椴tm-Hmgr蛋白活性的多肽的核苷酸序列，所述的核苷酸序列與SEQ ID NO.3中從核苷酸第131-1888位的核苷酸序列有至少70％的同源性；或者所述的核苷酸序列能在40-55℃條件下與SEQ ID NO.3中從核苷酸第131-1888位的核苷酸序列雜交。本發(fā)明是一種3-羥基-3-甲基戊二酰輔酶A的還原酶，有助于提高南京椴中萜類(lèi)化合物次生代謝產(chǎn)物或其前體的含量，且可以開(kāi)拓新蛋白資源，對(duì)于保護(hù)人民的健康生長(zhǎng)將有所幫助，同時(shí)對(duì)我國(guó)的農(nóng)業(yè)和醫(yī)藥的研究和發(fā)展具有重要的意義。