5-醛基胞嘧啶的標記方法及其在單堿基分辨率測序中的應用
本項目采用化學生物學手段,篩選出特異性成環標記5-醛基胞嘧啶(5fC)的化合物——疊氮茚二酮和丙二腈,并且標記產物在隨后的PCR擴增過程實現胞嘧啶(C)到胸腺嘧啶(T)的轉變,可實現全基因組5-醛基胞嘧啶的單堿基分辨率檢測。用疊氮茚二酮標記作為標記化合物,可實現對含有5-醛基胞嘧啶DNA片段的先富集再測序,將測序成本大大降低。用生物相容性很好的丙二腈作為標記化合物,可實現單細胞水平的5-醛基胞嘧啶單堿基分辨率檢測。血液中細胞外游離DNA上的核酸修飾可以作為人類癌癥的生物標記物,本項目涉及的核酸修飾檢測技術,不會造成DNA降解,適應于臨床小量珍貴樣品,在癌癥的液態活檢上具有重大潛力。
北京大學
2021-02-01