一批潛在新冠病毒棘突蛋白抑制劑的研究
南方科技大學(xué)生物系副教授王冠宇研究團(tuán)隊(duì)、醫(yī)學(xué)院教授張健研究團(tuán)隊(duì)聯(lián)合深圳大學(xué)總醫(yī)院李海鷹研究團(tuán)隊(duì)初步篩選出一批新型冠狀病毒棘突蛋白(spike glycoprotein)潛在抑制劑,相關(guān)成果發(fā)布在預(yù)印版平臺Research Square。 研究表明,新冠病毒利用其包膜上的棘突蛋白識別人類細(xì)胞膜受體蛋白ACE2,從而侵染人類細(xì)胞,引發(fā)嚴(yán)重的呼吸道感染癥狀。阻止病毒棘突蛋白與人類受體蛋白ACE2相互作用是研發(fā)有關(guān)藥物、抗體和疫苗的重要方向。 新冠病毒棘突蛋白抑制劑篩選策略 聯(lián)合研究團(tuán)隊(duì)為加快有關(guān)抑制劑的發(fā)現(xiàn),采用“老藥新用(Drug repurposing)”的策略,以公開的RBD-ACE2復(fù)合物晶體結(jié)構(gòu)為靶點(diǎn),通過同源建模(Homology Modeling)、計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)(Computer-aided drug design, CADD)和虛擬篩選(Virtual screening)等計(jì)算生物學(xué)方法,篩選了近15000個(gè)小分子化合物。這些化合物包含Drugbank化合物庫中所有的FDA批準(zhǔn)藥物,以及TCMSP化合物庫中的天然活性產(chǎn)物。研究團(tuán)隊(duì)將這些化合物與病毒棘突蛋白受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域進(jìn)行分子對接,發(fā)現(xiàn)一批結(jié)合非常緊密的化合物,如Digitoxin,Nilotinib,Lemborexant,Raltegravir,Bisindigotin和 Evodiamine等。 Digitoxin與棘突蛋白結(jié)合模式圖 Bisindigotin與棘突蛋白結(jié)合模式圖
南方科技大學(xué)
2021-04-10