5-醛基胞嘧啶的標(biāo)記方法及其在單堿基分辨率測序中的應(yīng)用
本項(xiàng)目采用化學(xué)生物學(xué)手段,篩選出特異性成環(huán)標(biāo)記5-醛基胞嘧啶(5fC)的化合物——疊氮茚二酮和丙二腈,并且標(biāo)記產(chǎn)物在隨后的PCR擴(kuò)增過程實(shí)現(xiàn)胞嘧啶(C)到胸腺嘧啶(T)的轉(zhuǎn)變,可實(shí)現(xiàn)全基因組5-醛基胞嘧啶的單堿基分辨率檢測。用疊氮茚二酮標(biāo)記作為標(biāo)記化合物,可實(shí)現(xiàn)對含有5-醛基胞嘧啶DNA片段的先富集再測序,將測序成本大大降低。用生物相容性很好的丙二腈作為標(biāo)記化合物,可實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞水平的5-醛基胞嘧啶單堿基分辨率檢測。血液中細(xì)胞外游離DNA上的核酸修飾可以作為人類癌癥的生物標(biāo)記物,本項(xiàng)目涉及的核酸修飾檢測技術(shù),不會造成DNA降解,適應(yīng)于臨床小量珍貴樣品,在癌癥的液態(tài)活檢上具有重大潛力。
北京大學(xué)
2021-01-12