本發明公開了一種瑪納斯海洋芽孢桿菌E40208a1及其應用。該菌株次級代謝產物發酵液對馬鈴薯Y病毒(Potato virus Y, PVY)引起的病毒病害具有顯著拮抗作用,且材料來源廣泛,成本低,對環境安全。