對流免疫電泳瓊脂板打孔器包括打孔管、固定板、固定板框、把手和負壓筒;打孔管通過軟管與負壓筒連通;在固定板框相對邊的內側設置有滑道,所述固定板的兩端可滑動地設置在所述滑道內,在固定板的至少一端設置一個撥塊,撥塊位于固定板框外側,在固定板框上設置有供所述撥塊滑動的滑槽;在滑道內設置有位移傳感器,在固定板框或把手上設置有位移顯示屏。本發明可以對瓊脂糖凝膠板一次打很多孔,且能自動將孔內的瓊脂糖吸出,只需要單手即可完成整個操作,高效、方便。