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中試階段/n該項目所用的材料是牛皰疹病毒1型BHV-1臨床分離株，具有全部的毒力因子和其他免疫原性很好的抗原。因此，以該病毒為基礎構建的牛傳染性鼻氣管炎ΔTK/ΔgE基因缺失標志菌株所制備的基因工程疫苗對牛免疫具有很強的針對性，具有廣闊的市場應用前景。

  在該研究的訓練組和驗證組人群中，CRC診斷模型和預后預測模型均表現出了令人滿意的效果。在訓練組和驗證組的人群中，該診斷模型準確率均達到96%，并且在驗證組中該模型診斷敏感性達87.9%，特異性達89.6%，相對于目前臨床常用的結直腸癌血清標志物癌胚抗原CEA的準確率為67%，診斷準確度大幅度提高。在對患者預后預測的準確性方面，根據ctDNA甲基化標志物預后預測模型計算得到聯合預后評分指數（cp-score）對患者的預后預測的準確性要明顯高于臨床常用的預后指標，如腫瘤原發部位、TMN分期、CEA等。而將cp-score與這些常規預后指標結合以后，對患者預后預測的準確性還能夠得到進一步的提高，在訓練組患者中對預后預測的準確性達到82%，在驗證組患者中對預后預測的準確性達到87%。對預后的準確預測，可很好的指導醫生對不同的患者進行更為個體化的精準治療，例如對預后不佳者避免給予過度的治療，而對復發高危患者則給予更為積極的輔助治療等。? 研究團隊還在前瞻性隊列中驗證了單個ctDNA甲基化標志物在結直腸癌篩查中的價值。通過對1493例結直腸癌高危人群同時進行的腸鏡篩查和血漿ctDNA甲基化檢測結果進行比較，顯示ctDNA甲基化標志物可檢測出26例早期腸癌患者，26例進展期腺瘤（癌前病變），對腫瘤的檢出敏感性達89.7%，特異性達86.8%，對進展期腺瘤的檢出率敏感性達33.3%，敏感性和特異性均較現有的無創篩查方法有所提高。這一研究結果對于優化結直腸癌篩查，具有重要的意義，有非常廣闊的應用前景。       徐瑞華教授團隊的這項成果是我國科學家在腫瘤液體活檢領域又一項具有國際領先水平的重大突破，不僅為CRC的篩查提供了新的方法，也為CRC的精準診治提供了重要的參考。目前該團隊仍在積極開展ctDNA分子標志物在其他腫瘤篩查、診斷、預后預測、靶向藥物篩選等方面的基礎和轉化研究，為發現更多的早期腫瘤患者，進一步改善患者的療效和預后，提供更多、更有力的工具和手段。

合成了一個具有光敏性的三苯胺橋聯的三腳架型鉑配合物Pt-tripod，在體外和體內都表現出高潛力的DNA靶向光動力治療抗腫瘤效果。機制研究表明，通過光照，Pt-tripod可以誘導細胞產生ROS并快速損傷DNA，也包括G-四鏈體DNA（Chem. Eur. J, 2017, 23: 16442–16446.）。在前期研究的基礎之上，毛宗萬教授研究團隊在鉑配合物Pt-tripod與G-四鏈體的NMR結構解析上取得了突破性進展。實驗研究發現，Pt-tripod能特異性靶向混合I型人體端粒G-四鏈體DNA，并能顯著抑制端粒酶的活性。利用NMR方法深入探索了Pt-tripod與人體端粒G-四鏈體DNA序列Tel26的動態結合。NMR實驗表明，Pt-tripod可以逐漸誘導人體端粒G-四鏈體Tel26形成多個“Pt-tripod-Tel26”復合物，包括單體、二聚和多聚G-四鏈體與Pt-tripod的復合物。研究團隊確定了其中兩個復合物的NMR結構，分別是1:1和4:2 Pt-tripod-Tel26復合物結構。鉑配合物與G-四鏈體復合物的結構信息為設計合成特異性靶向混合型人體端粒G-四鏈體的鉑合物提供了結構基礎，同時對研究G-四鏈體DNA與小分子的動態結合以及小分子誘導多聚體G-四鏈體高級結構的形成具有指導性意義。

本發明提供的一種魚腸道微生物宏基因組總DNA的提取方法及試劑盒，其包括：(1)魚樣品取樣及魚體表微生物固定處理；(2)腸道微生物的獲取及菌體的收集；(3)細胞的包埋與裂解；(4)DNA的提取；(5)DNA保存。試劑盒主要成分：溶液A：為Tris、EDTA的混合溶液；B為Tris、EDTA、NaCl、PVP、異硫氰酸胍、Triton?X100、PMSF、β?巰基乙醇的混合溶液；C為Tris、EDTA、NaCl和DTT的混合溶液；溶液D為蛋白酶K、溶菌酶、Tris、NaCl、SDS的混合溶液；E為Tris飽和酚和氯仿混合液；F為異丙醇；G為乙醇水溶液。本發明得到的DNA片段純度高，宿主及宿主體表微生物DNA含量少。

研發階段/n一種豬藍耳病基因重組豬霍亂沙門氏菌疫苗及應用。　　成果簡介：沙門氏菌是一種胞內寄生的革蘭氏陰性腸道桿菌，具有侵襲性。減毒沙門氏菌為載體的基因工程疫苗具有無法比擬的優越性，口服該種基因工程疫苗可以在激發產生抗沙門氏菌免疫應答的同時誘發特異性針對外源蛋白的體液和細胞免疫。豬藍耳病是由豬繁殖與呼吸綜合征病毒（PRRSV）引起的一種以妊娠母豬繁殖障礙以及仔豬呼吸道疾病的高度接觸傳染病，可對豬場造成巨大的損失。本發明涉及一種豬藍耳病基因重組豬霍亂沙門氏菌疫苗及應用，屬于動物細菌基因工程技術領域，具

01. 成果簡介 中東呼吸綜合征冠狀病毒（MERS-CoV）是2012年在中東地區首先發現的一種新型冠狀病毒，與嚴重急性呼吸綜合征冠狀病毒（SARS-CoV）同屬于β冠狀病毒，能夠引發嚴重的人類呼吸系統疾病。據世界衛生組織的最新統計表明，MERS-CoV已造成全球27個國家2428例感染，致死率高達35%。 MERS-CoV表面刺突蛋白（Spike）蛋白是病毒顆粒與細胞受體二肽基肽酶4（DPP4）作用的關鍵蛋白，也是MERS-CoV疫苗與保護性單克隆抗體研究的熱門靶點。本項目團隊在靶向刺突蛋白的高活性中和抗體篩選、鑒定、分子結構研究中取得了一系列突破。本團隊在國際上首批報道了兩株人源MERS-CoV中和抗體MERS-4與MERS-27，它們均能高效抑制假病毒與活病毒對體外培養細胞的侵染，在動物模型中也顯示了很好的保護作用。該團隊還綜合運用結構生物學、生物化學以及病毒學研究方法闡明了這兩株抗體識別Spike受體結合結構域（RBD）的不同位點，并阻斷Spike與受體DPP4的結合。 本項目團隊還利用一種稀有黑猩猩腺病毒AdC68為載體，搭載MERS-CoV表面全長的Spike蛋白，在轉基因小鼠（hDPP4-KI）模型中，一次滴鼻免疫即可誘導產生長期保護性免疫反應，并完全預防小鼠感染或降低感染后的疾病進展速度。解決了目前研發的MERS-CoV疫苗大多需要進行多次免疫注射的復雜程序問題。進一步的抗體分析表明，免疫動物血清中含有廣譜高滴度針對RBD的多克隆和單克隆中和抗體，能夠有效阻斷病毒與受體DPP4的結合，從而解析了其長期保護性免疫反應的分子基礎和機制，為疫苗下一階段進入大動物模型和人體臨床試驗做好了準備。                        MERS-CoV及其相關中和抗體和疫苗研究時間軸AdC68-S重組疫苗在hDPP4-KI轉基因小鼠模型上的保護效果02. 應用前景 本項成果可應用于治療或預防中東呼吸綜合征冠狀病毒的抗體藥物及疫苗候選物。03. 知識產權 本項成果已申請4項發明專利，其中3項已授權。04. 團隊介紹 本項目團隊由生命學院實驗室與醫學院實驗室聯合組成，兩位實驗室負責人分別為清華大學生命學院和醫學院教授、博士生導師，主要研究方向分別為結構生物學與病毒學，已發表國內外高水平學術論文數十篇，聯合申請專利4項。05.合作方式 技術許可。06.聯系方式 郵箱：zhangxinrui@tsinghua.edu.cn

隨著世界養豬業的發展，規模化飼養技術的應用和飼養高度密 集，以及突發腹瀉因素存在，使得豬腹瀉病日趨流行，危害日漸嚴重。豬傳染 性胃腸炎與流行性腹瀉在養豬場引起豬腹瀉病的報道屢見不鮮，特別是規模化 豬場在受到藍耳病、圓環病等感染之后免疫功能下降時，豬腹瀉類病伺機暴發， 導致較嚴重的經濟損失。本成果是利用自主分離鑒定豬傳染性胃腸炎與流行性 腹瀉病毒，通過基因工程的方法，在乳酸菌中進行表達，通過優化培養工藝， 提高乳酸菌的培養密度，混合研制的多價口服疫苗，用于該類疾病的免疫預防。 該產品的開發為該病的防控起到重要作用，具有重要的應用價值和經濟效益。 

腹瀉是導致仔豬死亡的頭號疾病，每年給我國生豬生產帶來巨大經濟損失。目前，導致仔豬高發病率和高死亡率的主要致病原是變異株豬流行性腹瀉病毒（vPEDV）和新現豬丁型冠狀病毒（Porcine deltacoronavirus, PDCoV）。然而，目前國內外尚無防控vPEDV和PDCoV感染致病的疫苗。 本科技成果是我校動科院預防獸醫學以唐玉新教授為首的科研團隊聚焦于豬腸道腹瀉病原研究，成功分離出穩定、高滴度的vPEDV和PDCoV為基礎成功研制而成。PDCoV是導致仔豬腹瀉的新現豬丁型冠狀病毒，該團隊在我國大陸本土首先發現并進行了系統研究，成果率先在國際SCI源刊物報道，該論文已成為ESI熱點論文（2015）和高被引論文（2016），實現了江西農業大學高被引論文零的突破（引自：基于ESI的江西農業大學優勢學科評估分析報告（第1期），圖書館信息簡報，2017年6月）。vPEDV+PDCoV疫苗創制工作，獲得“十三五”國家重點研發專項資助（2017YFD0500600），目前已經完成實驗室階段等工作，即將進入臨床試驗階段；成果目前已經轉讓給國內一家疫苗上市公司，轉讓金額1500萬元。本項目研究產品有望成為我國一類新獸藥，上市后，將產生巨大的經濟效益和社會效益，據估算，每年可減少仔豬死亡約1000萬頭，創造直接經濟效益>100億元，對提高生豬生產效益，降低動物病原對人類的威脅，保障人類健康和動物源食品安全，維持CPI穩定均可起到十分的重要作用。

國際頂級綜合期刊美國科學院院刊（PNAS）在線發表動物醫學院孔慶科博士課題組在多糖疫苗研究中的重要研究成果“Synthesis and delivery of Streptococcus pneumoniae capsular polysaccharides by recombinant attenuated Salmonella vaccines”（減毒沙門氏菌疫苗合成及遞送來源于肺炎鏈球菌的多糖抗原）。該研究首次通過合成生物學，細菌遺傳學及免疫學等方法，將革蘭氏陽性細菌的表面多糖抗原成功表達合成于革蘭氏陰性細菌減毒沙門氏菌的表面，并連接于沙門氏菌內毒素的類脂A上，利用遺傳改造及調控的減毒沙門菌疫苗載體遞送肺炎鏈球菌的多糖抗原開發新型疫苗。該方法突破了目前固有的陽性細菌多糖疫苗的構建方式，為將來快速、高效的構建多糖疫苗奠定了基礎。 博士后蘇華荔及青年教師劉青博士為共同第一作者，動物醫學院孔慶科博士為通訊作者，西南大學為第一完成單位及第一通訊作者單位。美國科學院院士、佛羅里達大學Curtiss教授為共同通訊作者，動物醫學院2017級碩士研究生卞曉萍及佛羅里達大學王世峰博士參與相關工作。該研究得到國家自然科學基金及美國NIH項目的資助。

已有樣品/n豬流行性腹瀉病毒重組豬霍亂沙門氏菌基因工程活疫苗及制備與應用。　　成果簡介：本發明的重組菌株表達的是豬傳染性胃腸炎病毒和豬流行性腹瀉病毒的保護性抗原基因。其中S蛋白的A、D抗原位點和N蛋白的N321抗原位點是豬傳染性胃腸炎病毒重要的免疫原性基因片段，COE基因和SD基因是豬流行性腹瀉病毒重要的免疫原性基因片段，均具有良好的免疫保護性。可以同時提供針對豬霍亂沙門氏菌、傳染性胃腸炎病毒和豬流行性腹瀉病毒三種病原的保護力。　　應用前景：目前，PED商品化疫苗主要有滅活苗和弱毒苗兩種，這兩種疫苗