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生物多樣性包括物種多樣性、遺傳多樣性和生態(tài)系統(tǒng)多樣性，其成因是生物學(xué)中的核心問題之一。陸地環(huán)境中，山區(qū)生態(tài)系統(tǒng)蘊(yùn)藏著異常多樣的陸地生物多樣性，可能的解釋包括巨大的海拔梯度變化形成了多樣的微環(huán)境，促進(jìn)了種群的分化。

項(xiàng)目成果/簡介:云南大學(xué)省部共建云南生物資源保護(hù)與利用國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室張志剛團(tuán)隊(duì)于2020年2月2日開始對之前發(fā)表的馬來穿山甲病毒組學(xué)數(shù)據(jù)(該數(shù)據(jù)由2019年3月24日無法救護(hù)成功的穿山甲肺的樣本獲取)（Liu et al. 2019, Viruses 11, 979）進(jìn)行重新組裝和全面系統(tǒng)地分析，發(fā)現(xiàn)這批馬來穿山甲攜帶SARS-CoV-2相近的冠狀病毒（命名為Pangolin-CoV），其與SARS-C

該研究揭示了轉(zhuǎn)座子MITE-MdRF1通過影響MdRFNR1-1表達(dá)進(jìn)而調(diào)控蘋果抗旱的分子機(jī)制。轉(zhuǎn)座子（Transposable element,TE）廣泛分布于真核生物基因組中，是一種可移動(dòng)的DNA單元，通常情況處于沉默狀態(tài)以維持基因組的穩(wěn)定性。

植物地上-地下生物量的分配格局影響陸地生態(tài)系統(tǒng)碳循環(huán)，是估算生態(tài)系統(tǒng)碳存儲的關(guān)鍵。在全球變化的背景下，探討植物生物量分配對氣候因子的響應(yīng)是理解和預(yù)測陸地碳存儲的基礎(chǔ)。

云南大學(xué)省部共建云南生物資源保護(hù)與利用國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室張志剛團(tuán)隊(duì)于2020年2月2日開始對之前發(fā)表的馬來穿山甲病毒組學(xué)數(shù)據(jù)(該數(shù)據(jù)由2019年3月24日無法救護(hù)成功的穿山甲肺的樣本獲取)（Liu et al. 2019, Viruses 11, 979）進(jìn)行重新組裝和全面系統(tǒng)地分析，發(fā)現(xiàn)這批馬來穿山甲攜帶SARS-CoV-2相近的冠狀病毒（命名為Pangolin-CoV），其與SARS-CoV-2和BatCoV RaTG13（武漢病毒所石正麗團(tuán)隊(duì)報(bào)道）的基因組相似性分別為91.02%和90.55%。Pangolin-CoV與SARS-CoV-2的親緣關(guān)系僅次于RaTG13，但是Pangolin-CoV與SARS-CoV-2的S1功能基序高度一致，涉及與人類ACE2受體互作的五個(gè)關(guān)鍵氨基酸殘基完全一致，而RaTG13發(fā)生了四個(gè)突變，提示了Pangolin-CoV與SARS-CoV-2具有相似的宿主細(xì)胞識別能力。 新冠肺炎疫情(COVID-19)自2019年底爆發(fā)以來，迅速在世界范圍擴(kuò)散流行，新冠肺炎疫情是由嚴(yán)重急性呼吸系統(tǒng)綜合癥冠狀病毒2型（SARS-CoV-2）引起的，控制COVID-19全球大流行，病毒溯源及其傳播途徑研究是當(dāng)前的關(guān)鍵任務(wù)之一。 該研究首次全面澄清了SARS-CoV-2與穿山甲冠狀病毒（Pangolin-CoV）、蝙蝠冠狀病毒（RaTG13）、2003年非典型肺炎冠狀病毒（SARS -CoV）以及2015年中東呼吸綜合征冠狀病毒（MERS-CoV）的關(guān)系，認(rèn)為除了蝙蝠和穿山甲之外，SARS-CoV-2還存在其它未知中間宿主，為進(jìn)一步攻克病毒源頭和傳播路徑提供了寶貴的參考。同時(shí)，該研究也呼吁保護(hù)加強(qiáng)野生動(dòng)物保護(hù)和管理，保護(hù)野生動(dòng)物，就是保護(hù)人類自己。