一種新的錄組測序快速建庫方法

生物、醫藥及醫療機械

基于SHERRY方法的轉錄組測序建庫流程如圖1所示，樣本可以來自裂解的單細胞或bulk RNA；RNA分子經過oligo-dT 引物的反轉錄后，RNA/DNA雜合鏈可直接被Tn5轉座酶打斷（圖中灰色的波浪線及直線分別代表RNA及DNA分子）；在Tagmentation之后，轉座酶會在雜合鏈兩端加上adaptor接頭，進行之后的建庫PCR擴增。　基于100pg的RNA起始量，SHERRY表現出了高的read匹配率，同時可檢測出近9000個基因，其中72%的基因可在三個重復樣本中檢測出，可重復性較好。與目前普遍應用于單細胞轉錄組測序的Smart-seq2技術相比，SHERRY與其建庫質量不相上下，并且具較低的GC bias。此外，SHERRY整個流程僅需要5個步驟，且可在一個管子中完成，整個時間僅約4小時，其中手工操作時間不到半小時。相比之下，Smart-seq2整個耗時約為SHERRY二倍的時間，且需要一些前處理等操作；此外，包含十個步驟的NEBNext方法則需要更加多的實驗室操作和時間成本。值得一提的是，在成本方面，SHERRY方法僅為其他兩種方法的五分之一，將大大節省實驗成本。

小批量或小范圍應用